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PCR實驗室設計的中心問題是如何避免污染。在實際工作中，常見的有以下幾種污染類型：擴增產(chǎn)物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發(fā)生污染，實驗就必須停止，直到找到污染源為止，而且實驗結果必須作廢，需重新進行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣，浪費人力物力。因此要避免污染，首先應是預防，而不是排除。PCR擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域：試劑貯存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)、擴增產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染，進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行，即只能從試劑貯存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增反應混合物配制和擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)。 各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。pcr儀的使用說明是什么？福建推薦pcr原理

原位PCR就是在組織細胞里進行PCR反應，它結合了具有細胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術的優(yōu)點，是細胞學科研與臨床診斷領域里的一項有較大潛力的新技術。原位PCR是Hasse等于1990年建立的，實驗用的標本是新鮮組織、石蠟包埋組織、脫落細胞、血細胞等。其基本方法為：1、固定組織或細胞:將組織細胞固定于預先用四氟乙烯包被的玻片上，并用多聚甲醛處理，再滅活除去細胞內(nèi)源性過氧化物酶。2、蛋白酶K消化處理:用60ug/ml的蛋白酶K將固定好的組織細胞片55℃消化處理2h后，96℃2min以滅活蛋白酶K。3、PCR擴增:在組織細胞片上，加PCR反應液，覆蓋并加液體石蠟后，直接放在擴增儀的金屬板上，進行PCR循環(huán)擴增。有的基因擴增儀帶有專門用于原位PCR的裝置。4、雜交:PCR擴增結束后，用標記的寡核苷酸探針進行原位雜交。5、顯微鏡觀察結果。湖南組織pcr價格簡述熒光定量pcr的基本原理。

PCR的假陽性主要原因之一引物設計不合適：選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性，因而在進行PCR擴增時，擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短，容易出現(xiàn)假陽性。需重新設計引物。靶序列或擴增產(chǎn)物的交叉污染：這種污染有兩種原因：一是整個基因組或大片段的交叉污染，導致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決：操作時應小心輕柔，防止將靶序列吸入加樣器內(nèi)或濺出離心管外。除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外，所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管及樣進器頭等均應一次性使用。必要時，在加標本前，反應管和試劑用紫外線照射，以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染，這些小片段比靶序列短，但有一定的同源性。可互相拼接，與引物互補后，可擴增出PCR產(chǎn)物，而導致假陽性的產(chǎn)生，可用巢式PCR方法來減輕或消除。

PCR實驗技術中的定量PCR介紹：由于序列擴增的產(chǎn)量依賴于模板DNA的量，所以PCR常用于對樣品中DNA進行定量，常用的應用是基因表達的定量。終點法PCR是一種可能的方法，但其有較大的缺點，通過凝膠電泳來檢測產(chǎn)量，檢測的靈敏度非常有限。更重要的是，使用終點PCR是在PCR反應結束后進行定量，此時擴增已經(jīng)達到平臺期，DNA凝膠染色的強度與DNA起始量不成線性關系。盡管如此，通過終點法PCR可以對基因表達進行半定量，可以使用一系列稀釋程度不同的DNA樣本作為模板起始量，或者在特定的PCR循環(huán)處獲取擴增產(chǎn)物，然后通過凝膠顯色強度來估計基因的表達量。pcr檢測有哪些操作步驟？

PCR反應的特異性強，其決定因素為：①引物與模板DNA特異正確的結合；②堿基配對原則；③TaqDNA聚合酶合成反應的忠實性；④靶基因的特異性與保守性。其中引物與模板的正確結合是關鍵。引物與模板的結合及引物鏈的延伸是遵循堿基配對原則的。聚合酶合成反應的忠實性及TaqDNA聚合酶耐高溫性，使反應中模板與引物的結合（復性）可以在較高的溫度下進行，結合的特異性明顯增加，被擴增的靶基因片段也就能保持很高的正確度。再通過選擇特異性和保守性高的靶基因區(qū)，其特異性程度就更高。英瀚斯生物分子生物學平臺，配備專業(yè)定量pcr儀。福建常見pcr檢測

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PCR實驗技術中cDNA第二鏈的合成方法有以下幾種:1、自身引導法合成的單鏈cDNA3'端能夠形成一短的發(fā)夾結構，這就為第二鏈的合成提供了現(xiàn)成的引物，當***鏈合成反應產(chǎn)物的DNA:RNA雜交鏈變性后利用大腸桿菌DNA聚合酶ⅠKlenow片段或反轉錄酶合成cDNA第二鏈，***用對單鏈特異性的S1核酸酶消化該環(huán)，即可進一步克隆。但自身引導合成法較難控制反應，而且用S1核酸酶切割發(fā)夾結構時無一例外地將導致對應于mRNA5'端序列出現(xiàn)缺失和重排，因而該方法目前很少使用。2、置換合成法該方法利用鏈在反轉錄酶作用下產(chǎn)生的cDNA:mRNA雜交鏈不用堿變性，而是在dNTP存在下，利用RNA酶H在雜交鏈的mRNA鏈上造成切口和缺口。從而產(chǎn)生一系列RNA引物，使之成為合成第二鏈的引物，在大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ的作用下合成第二鏈。該反應有3個主要優(yōu)點:(1)非常有效；(2)直接利用鏈反應產(chǎn)物，無須進一步處理和純化；(3)不必使用S1核酸酶來切割雙鏈cDNA中的單鏈發(fā)夾環(huán)。福建推薦pcr原理

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