PCR由變性--退火--延伸三個基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:
1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準備。
2、模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍 英瀚斯生物,分子平臺實驗人員十年以上經(jīng)驗,專業(yè)pcr檢測。山西有哪些pcr原理
PCR的假陽性主要原因之一出現(xiàn)非特異性擴增帶:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān)。其次是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:必要時重新設(shè)計引物。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。PCR的假陽性主要原因之一出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有:減少酶量,或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃度。增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。河北高質(zhì)量pcr公司大鼠、小鼠血清做pcr檢測哪家好?
PCR實驗技術(shù)中的RT-PCR介紹:在RT-PCR中,通過逆轉(zhuǎn)錄(RT)將RNA轉(zhuǎn)化為cDNA,然后通過聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)擴增cDNA(圖1)。利用cDNA擴增步驟,有望對初始RNA進行進一步研究,即便RNA樣本數(shù)量有限或低豐度表達。RT-PCR的常見應(yīng)用包括表達基因檢測、轉(zhuǎn)錄物變異檢測,以及克隆和測序用cDNA模板制備。由于逆轉(zhuǎn)錄可為PCR擴增和下游實驗提供cDNA模板,因此,它是實驗成功的關(guān)鍵步驟之一。選定的逆轉(zhuǎn)錄酶應(yīng)對所有樣本均具有**高效率,即便是難轉(zhuǎn)錄RNA樣本,如降解、抑制劑殘留或具有高度二級結(jié)構(gòu)的RNA樣本。一步法和兩步法是兩種**常用的RT-PCR方法,每種方法都具有各自的優(yōu)缺點。RNA的多聚酶反應(yīng)(RT-PCR)是以RNA為模板,聯(lián)合逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(reversetranscription,RT)與PCR,可用于檢測單個細胞或少數(shù)細胞中少于10個拷貝的RNA模板。
PCR引物設(shè)計的原則PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。(1)引物設(shè)計的基本原則引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應(yīng)存在互補序列,尤其是避免3′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個堿基,應(yīng)嚴格要求配對,比較好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。pcr檢測實驗數(shù)據(jù)如何分析?
PCR反應(yīng)五要素:參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即:引物(PCR引物為DNA的片段,細胞內(nèi)DNA復(fù)制的引物為一段RNA鏈)、酶、dNTP、模板和緩沖液(其中需要Mg2+)。引物有多種設(shè)計方法,由PCR在實驗中的目的決定,但基本原則相同。PCR所用的酶主要有兩種來源:Taq和Pfu,分別來自兩種不同的噬熱菌。其中Taq擴增效率高但易發(fā)生錯配。Pfu擴增效率弱但有糾錯功能。所以實際使用時根據(jù)需要必須做不同的選擇。模板即擴增用的DNA,可以是任何來源,但有兩個原則,1號純度必須較高,第二濃度不能太高以免抑制。緩沖液的成分較為復(fù)雜,除水外一般包括四個有效成分:緩沖體系,一般使用HEPES或MOPS緩沖體系;一價陽離子,一般采用鉀離子,但在特殊情況下也可使用銨根離子;二價陽離子,即鎂離子,根據(jù)反應(yīng)體系確定,除特殊情況外不需調(diào)整;輔助成分,常見的有DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。熒光定量pcr和實時定量pcr的區(qū)別?浙江熒光定量pcr怎么樣
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PCR原理:PCR是在試管中進行的DNA復(fù)制反應(yīng),基本原理是依據(jù)細胞內(nèi)DNA半保留復(fù)制的機理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉(zhuǎn)變的性質(zhì),人為地控制體外合成系統(tǒng)的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過程每一步的轉(zhuǎn)換是通過溫度的改變來控制的。需要重復(fù)進行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結(jié)合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸3個步驟構(gòu)成PCR反應(yīng)的一個循環(huán),此循環(huán)的反復(fù)進行,就可使目的DNA得以迅速擴增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94℃。退火:引物+單鏈DNA?雜交鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70℃左右,TaqDNA聚合酶以4種dNTP為原料,以目的DNA為模板,催化以引物3’末端為起點的5’→3’DNA鏈延伸反應(yīng),形成新生DNA鏈。新合成的引物延伸鏈經(jīng)過變性后又可作為下一輪循環(huán)反應(yīng)的模板PCR,就是如此反復(fù)循環(huán),使目的DNA得到高效快速擴增。山西有哪些pcr原理
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