在藻類生長所需的大量元素中，磷、氮通常是水體浮游植物增長的限制性因子，總氮大于1.2毫克/升、總磷大于0.11毫克/升時水體開始富營養(yǎng)化，在淡水中當總磷小于0.1毫克/升時藻類生長發(fā)展為磷限制。而過高的磷輸入如總磷為1.65毫克/升，并不能促進藻類生長。要培養(yǎng)出養(yǎng)殖所需要的有益藻、抑制藍藻、裸藻等有害藻，我們需要重點關注一些化學指標，總堿度、硬度、鹽度、氮、磷、碳以及微量元素鈣、鐵、錳、鋅等有可能成為限制性因子的指標。池塘中的有機質含量可通過檢測水中有機耗氧量得知，水中有機質含量高，氮磷的含量也會高，在降氨氮同時可以降低水體有機質含量。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統是以工業(yè)化手段主動控制水環(huán)境，水資源消耗小、占地少、對環(huán)境污染小、產品優(yōu)質安全、bing害少、密度高、養(yǎng)殖生產不受地域或氣候的限制和影響，資源利用率高，是高投入高產出，低風險實現水產養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展的重要途徑。機械過濾系統 機械過濾系統的主要功能就是通過不斷的循環(huán)，將水中魚類的糞便及多投的飼料等固體顆粒及膠體狀物質過濾分離出去。以避免它們留在養(yǎng)殖水體中繼續(xù)分解成對水生生物有毒的氨氮等物質。 機械過濾系統設備分很多種，常見的有微濾機、蛋白質分離器、過濾沙缸、精密過濾器等。微濾機經過水產設備的精心設計，早已實現全自動化。
在目前的發(fā)展水平下，循環(huán)水養(yǎng)殖模式較高的準入門檻使得循環(huán)水養(yǎng)殖與普通低附加值魚類無緣，而名貴海水魚類可養(yǎng)殖品種有限，限制了循環(huán)水養(yǎng)殖模式的發(fā)展。近些年來，經過專家學者和眾多的養(yǎng)殖企業(yè)的不斷探索，國內循環(huán)水養(yǎng)殖品種的豐富度大大提高，如：斑石鯛、墨瑞鱈魚、黃條鰤等。循環(huán)水養(yǎng)殖系統既是一個復雜的系統工程，又是一個矛盾的綜合體，因此，不可能存在一種十全十美、適用于所有養(yǎng)殖品種的循環(huán)水養(yǎng)殖系統，只要不出現明顯的設計漏洞，系統運行過程中遇到的很多問題，可以通過系統管理技術和養(yǎng)殖技術來解決。