在分解細菌的作用下，再進一步轉化成了氨。被魚類吃掉的一部分經(jīng)過魚類的消化，也轉變成氨。殊途同歸的氨在分子態(tài)時是一種劇毒物質。在硝化細菌的作用下，它會被轉化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩(wěn)定的物質。在高氧化還原電位的情況下，會被氧化成亞鹽。此時如果有反硝化細菌，鹽就會被轉化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個完整的轉化分離過程。 在實踐中，生物過濾的細菌需要適宜的條件才能起到相應的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統(tǒng)設備與生物過濾器配套，更對操作者有一定的技術要求。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)是以工業(yè)化手段主動控制水環(huán)境，水資源消耗小、占地少、對環(huán)境污染小、產(chǎn)品優(yōu)質安全、病害少、密度高、養(yǎng)殖生產(chǎn)不受地域或氣候的限制和影響，資源利用率高，是高投入高產(chǎn)出，低風險實現(xiàn)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展的重要途徑。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖采取集約化生產(chǎn)方式，減少了人力成本，降低了餌料系數(shù)。10%的養(yǎng)殖面積產(chǎn)出百分百的產(chǎn)量，這僅僅是其優(yōu)勢之一，更加環(huán)保的養(yǎng)殖方式，也提高了養(yǎng)殖品種的品質，可以獲得更好的產(chǎn)品售價和經(jīng)濟效益。消費者對高品質的水產(chǎn)品需求日益增長，傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式產(chǎn)出的水產(chǎn)品沒有太多的附加值空間，利潤小，風險高，已經(jīng)很難適應高端消費者的需求。
工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)不僅節(jié)能節(jié)水效果較好，而且還對防止養(yǎng)殖病害發(fā)生、實現(xiàn)養(yǎng)殖過程零用藥、提高產(chǎn)品質量和經(jīng)濟效益發(fā)揮重要的作用。